ในปัจจุบันมีระบบเครื่องกรองน้ำอยู่หลักๆ 2 ระบบ เรียงตามลำดับ ความนิยม มากไปน้อยดังนี้
1.ระบบ RO (REVERSE OSMOSIS) เป็นระบบการกรองที่ดีที่สุดและได้รับความนิยมมากในปัจจุบัน ใช้หลักการโดยใช้ปั๊มอัดแรงดันสูงอัดน้ำผ่านเนื้อเยื่อความละเอียดสูง ที่เรียกว่า membrane สามารถกรองน้ำทะเลเป็นน้ำจืดได้ 99.99% สามารถกรองจุลินทรีย์ได้ทุกชนิด ไวรัสทุกชนิด รวมถึง สารพิษทุกชนิดด้วย
2. ระบบ UF (ULTRA FILTRATION) เป็นระบบที่พัฒนาขึ้นมาเหนือระบบ MF ในราคาที่ไม่แพง ซึ่งระบบนี้จะสามารถกรองได้ละเอียดเล็กที่สุด 0.01 ไมครอนหรือบางที่อาจเรียกว่าไส้กรอง Hallow Fiber ระบบนี้สามารถเรียกได้ว่าเป็นระบบที่ปลอดเชื้อเพราะสามารถกรองจุลินทร์และไวรัสทุกชนิดได้
3. ระบบ MF (MICRO FILTER) เป็นระบบแรกที่ใช้กรองน้ำดื่ม ความละเอียดอยู่ที่ 0.1-0.9 ไมครอน วัสดุที่นิยมนำมาใช้ได้แก่ PP โพลิโพรไพลิน ความละเอียดอยู่ที่ 0.5 ไมครอน ราคาถูก และเซรามิก ความละเอียดอยู่ที่ 0.3 ไมครอน ราคาจะแพงขึ้นตามอันดับ โดยที่ระบบนี้ จะกรองได้เพียงจุลินทรีย์และแบคทีเรียบางชนิดเท่านั้น ปัจจุบันไม่นิยมใช้แล้ว
